У грудні 2018 року компанія SkyUp Airlines подала до Державної авіаційної служби заявку на виконання регулярних рейсів на ряд напрямків як з Києва, так і з інших міст України. За підсумками засідання Комісії з розгляду питань щодо прав на експлуатацію повітряних ліній були задоволені заявки авіакомпанії на здійснення регулярних рейсів за такими напрямками як:
- Київ - Подґоріца (Чорногорія) - Київ (частота рейсів: 3 рейси на тиждень)
- Львів - Прага (Чеська Республіка) - Львів (частота рейсів: 3 рейси на тиждень)
- Одеса - Прага (Чеська Республіка) - Одеса (частота рейсів: 3 рейси на тиждень)
- Харків - Прага (Чеська Республіка) - Харків (частота рейсів: 3 рейси на тиждень)
- Київ - Карлові Вари (Чеська Республіка) - Київ (частота рейсів: 3 рейси на тиждень)
- Харків - Тель-Авів (Держава Ізраїль) - Харків (частота рейсів: 2 рейси на тиждень)
Крім того, на сьогоднішній день авіакомпанія SkyUp Airlines отримала відмову на здійснення регулярних рейсів за такими напрямками як:
- Львів - Подґоріца (Чорногорія) - Львів (частота рейсів: 2 рейси на тиждень)
- Харків - Подґоріца (Чорногорія) - Харків (частота рейсів: 2 рейси на тиждень)
- Запоріжжя - Подґоріца (Чорногорія) - Запоріжжя (частота рейсів: 2 рейси на тиждень)
- Харків - Тірана (Республіка Албанія) - Харків (частота рейсів: 2 рейси на тиждень)
Таке рішення Комісії пов'язано з відсутністю зазначених маршрутів у міжурядових угодах про повітряне сполучення між країнами. Доки дані маршрути не будуть внесені до міжурядових угод для виконання регулярних рейсів, компанія SkyUp Airlines буде виконувати рейси на цих сполученнях на чартерній основі.
Заплановані рейси, на які вже ведеться продаж турів, не відміняються і будуть виконані згідно підписаних договорів з замовниками. У разі отримання призначень на регулярні рейси по зазначених маршрутах, авіакомпанія SkyUp Airlines відкриє власні продажі квитків на даних рейсах як з боку України, так і з боку країн польотів.